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Hekate経由で起動するAtmosphereを起動しようとした場合、failed to apply nosigchkと出てくる原因はその起動しようとした本体のバージョンに合ったsigpatchが入っていない
AtmoPack-Vanillaにはsigpatchが入っているのでそれを入れるのが一番手っ取り早いです
しかし、AtmoPack-Vanillaがバージョンに対応しているかどうかは下記のアカウントで呟いているので随時確認してください

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